برای اینکار کافی است از متد ()stop استفاده کنیم

$("div").stop(stopAll,goToEnd)
$("div").stop();

stopAll: متوقف کردن همه انیمیشن ها
goToEnd : اجرای  انیمشین جاری کامل شود یا خیر.در این حالت اجرای انیمیشنی که مشخص کردیم استاپ نمی شود اما بقیه انیمیشن ها استاپ می شوند